Lestadest on enamlevinud varroalest ja akarapidoosi tekitav trahhealest. Mesilaste söödavarusid, eriti suira, kahjustab suiralest. Täidest kahjustab mesilast peamiselt mesilastäi (täikärbes) e braula. Mardikatest on levinumad – tarumardikas, nahanäkk, kõrvahark ja villimardikas. Kiletiivalistest ohustavad mesilasi herilased, vaablased, küürkärblased ja mõned kiililiigid. Liblikatest on tuntumad suur- ja väike vahakoi. Roomajatest võivad mesilastele ohtlikud olla sisalikud; kahepaiksetest konnad; närilistest hiired, rotid ja karihiired; lindudest kärbsenäpp, herilaseviu, pääsukesed ja talveperioodil ka tihased. Loomadest tekitavad suuremat kahju karud ja nugised.
