Markiisaartele pani nime Hispaania meresõitja Álvaro de Mendaña, kes külastas saari 1595. aastal. Nime pani ta mõne allika kohaselt tollase Hispaania Peruu asekuninga, Cañete markii (Marqués de Cañete) García Hurtado de Mendoza y Manrique (1535–1609) auks. Teiste allikate kohaselt on nimi pandud sama markii abikaasa ehk markiisi auks ja seda kinnitab hispaania nime vorm (Marquesas on mitmuse vorm sõnast marquesa ’markiis’). Seega võiks saari eesti keeles nimetada Markiisisaarteks, kui poleks juba teatavat traditsiooni. (See pole siiski pikk, sest 1936 oli veel „Eesti entsüklopeedias“ Marquesas.)
